立體定位儀對于小動物的腦立體定位來說，是一種可靠的，多功能的設備。通過儀器的精確定位，可以確保電極、微管以及其它設備在實驗過程中的精確定位。其是利用大小鼠顱骨外面的前囟點，即Bragma點，或其它參考點所規定的三維坐標系統,來確定皮層下某些神經結構的位置,通過固定在立體定位儀操作臂上的顱鉆在特定三維坐標的神經結構的位置,鉆孔打開顱骨，以便在非直視暴露下對其進行定向的刺激、破壞、注射藥物、引導電位等研究。儀器的操作及維護需要相互配合，都要重視，下面我們來仔細說說。
一、使用步驟：
1. 固定上頜：擰松上頜固定裝置的旋鈕，向上移動使其在0上5mm，再旋緊旋鈕。
2. 插入耳桿：動物麻醉后，將耳桿緊貼雙耳分別插入兩外耳道;然后將耳桿固定在主框上，并使兩個耳桿的讀數相同。
3. 固定上頜：調節“壓環旋鈕”使壓環上移，將動物的上門齒鉤住門齒板的前桿，使門齒根部緊靠桿的上緣;旋松調節槽上“固定旋鈕”，在主框上前后移動至頭自然伸展、然后固定;下移“壓環旋鈕”，夾緊頭部。
二、日常維護：
1.輕拿輕放，避免儀器碰撞而受損
2.選擇實驗對象不要超過儀器的適用范圍
3.實驗結束后要及時清理儀器，保證其精確性
三、實驗過程：
1、先參照大鼠腦立體定位圖譜或者文獻確定腦內注射部位的坐標，包括前囟前或后多少mm，中線左或右多少mm，顱骨下深度為多少mm。
2、麻醉大鼠，然后固定在立體定位儀上，主要是固定鼻端和兩耳部位，固定后大鼠的頭部是不能動的。
3、剪去大鼠頭頂部毛，皮膚表面消毒，然后根據需要縱向或者橫向剪開皮膚，用棉球和眼科剪刀除去顱骨表面的腦膜，過一會顱骨干燥后找到前囟部位(靠前部的十字交叉點)，以前囟部位為原點，參考定位坐標把注射針移動到注射部位的上方，
4、在顱骨相應的位置用簽字筆點一個原點，移開注射針，用牙科轉在注射部位轉一個小孔，如果出血的話及時止血，再把注射針移回注射部位上方，吸入注射藥物，然后再參照定位注射坐標把注射針移動到注射部位，開始緩慢注入藥物，注射后留針一會，再緩慢把注射針移出腦內，縫合皮膚，肌肉注射青霉素抗感染，把動物放回飼養籠內，術后注意保溫。
