在安裝無菌動物隔離器時，需格外注意接口處密封性及塑料薄膜軟包和操作手套的完整性。充氣氣壓過高也可能損壞設備。安裝完成后需對隔離器內部進行全面滅菌，并運行一段時間進行完整性檢測和無菌檢測后才能投入使用。